TaqMan* 螢光 PCR 是一種新近發展出的技術，使用一個雙標記的 TaqMan 螢光探針，能實時檢測產生的 PCR 產物。螢光5'核酸為 PCR 化驗使用 Taq DNA 聚合酶下的5'-3'核酸活性切開 TaqMan 探針，該探針在 PCR 過程中與目的序列雜交在一起。當探針完整時，螢光染料因接近淬滅染料而被抑制。在 PCR 過程中，探針會退火到 DNA 模板上， Taq DNA 聚合酶的5'-3'核酸活性切開報告染料和淬滅染料，導致報告染料的信號增多。剩餘的探針從目的序列上分離開，使 PCR 反應繼續。螢光的強度和放入的目的 DNA 量直接相關。螢光信號通過使用 ABI Prism 7000或7700序列檢測系統（PE Applied Biosystems）捕獲，允許快速檢測96孔樣品。該儀器在 PCR 過程中通過分析每個循環作為擴增模板結果的瑩光信號來確定目的模板的最初量。達到螢光檢測水平花費的循環數越少，最初量越大。引物和探針必須雜交到目的序列上來擴增和發生切割。螢光信號只在探針的目的序列在 PCR 中擴增的情況下產生。因為這些條件，所以不會檢測到非特異性擴增。